Laboratorium Perbankan syariah, merupakan laboratorium yang memfasilitasi mahasiswa fakultas Ilmu Ekonomi bisnis Islam untuk dapat mempraktekkan Ilmu perbankan yang secara teori telah di ajarkan di perkuliahan . Tujuannya adalah mahasiswa mendapatkan gambaran konkret serta dapat mengamati proses-proses dari kegiatan-kegiatan dalam bidang ekonomi khususnya dalam dunia perbankan syariah.
Mata kuliah yang dapat di praktekan seperti layanan Prima, Layanan produk dan jasa Bank Syariah, Manajemen Dana Bank Syariah di Laboratorium Perbankan Syariah. Untuk pengelolaan Laboratorium ini sendiri fakultas Ilmu ekonomi bisnis islam berkerjasama dengan Bank BRI Syariah sebagai salah satu bank mitra IAIN Samarinda.